Η συνεχής και απρόσκοπτη αναπτυξιακή πορεία του Πανεπιστημίου Νεάπολις Πάφου, χάρις στην άοκνη προσπάθεια της Διοικούσας Επιτροπής και του Πρύτανη του Ιδρύματος Kαθ. Ηλία Ντινένη, στράφηκε και προς την κατεύθυνση της ικανοποίησης σοβαρού αιτήματος του πνευματικού κόσμου της Κρήτης.
Ο ελλόγιμος καθηγητής του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης σεβασμιότατος Μητροπολίτης κκ. Ανδρέας, ενέταξε στο πλούσιο αναπτυξιακό έργο στη Μητρόπολή του και τη συνεργασία του με το Πανεπιστήμιο Νεάπολις Πάφου. Οι διαπραγματεύσεις του Μητροπολίτη με τους καθηγητές κκ. Χρήστο Οικονόμου, Πρόεδρο της Επιστημονικής Επιτροπής του Μεταπτυχιακού Προγράμματος Θεολογικών Σπουδών, και του Νίκου Ζαχαρόπουλου, κοσμήτορα του εν λόγω Πανεπιστημίου, είχαν αίσιο πέρας, επωφελεία των αποφοίτων Ανωτάτων Σχολών. Υπό την αιγίδα του Οικουμενικού Πατριαρχείου και την έγκριση της Ι. Συνόδου της Κρήτης δίδεται η ευκαιρία στους Θεολόγους, κληρικούς και λαϊκούς αλλά και άλλων αποφοίτων Ανθρωπιστικών Πανεπιστημιακών Σχολών, καθώς και σε εκείνους των Ανωτάτων Εκκλησιαστικών Ακαδημιών, να πραγματοποιήσουν μεταπτυχιακές σπουδές. Το ευεργέτημα αυτό έχει ιδιαίτερη σημασία για τους τελευταίους, μια που μέχρι σήμερα δεν υπήρχε η δυνατότητα αυτή. Οι σπουδές πραγματοποιούνται στο Πανεπιστήμιο Νεάπολις Πάφου, ενώ ένα τελευταίο μέρος τους στο Αρκαλοχώρι Κρήτης, όπου οι εξαίρετες εγκαταστάσεις του Πολιτιστικού Κέντρου της Μητροπόλεως Αρκαλοχωρίου, Καστελλίου και Βιάννου, προκειμένου οι σπουδαστές κατά το τέλος εκάστου εξαμήνου να μελετούν επί τόπου τα απαραίτητα στοιχεία για τη σύνταξη των εργασιών τους (άρθρα) αλλά και για την τελική προς εκπόνηση διπλωματική μελέτη τους. Το πανεπιστήμιο Νεάπολις Πάφου φιλοδοξεί να καλύψει, όσον ένεστι, τις ζητήσεις των ατόμων που έχουν ιδιαίτερη έφεση όχι μόνο για σπουδή, αλλά και αριστεία.
